Fragment-based drug design has introduced a bottom-up process for drug development, with improved sampling of chemical space and increased effectiveness in early drug discovery. Here, we combine the use of pharmacophores, the most general concept of representing drug-target interactions with the theory of protein hotspots, to develop a design protocol for fragment libraries. The SpotXplorer approach compiles small fragment libraries that maximize the coverage of experimentally confirmed binding pharmacophores at the most preferred hotspots. Our carefully selected High Solubility Pharmacophore Fragment library contains 985 fragment small molecules.
パッケージサイズ |
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1 mg |
5 mg |
10 mg |
フラグメント創薬(fragment-based drug design:FBDD)では理論的に有望なフラグメントの組合せによる分子設計で、高活性な薬剤候補を得ることが可能です。数百万の巨大な分子をスクリーニングする手法と比較して、FBDDでは数千のフラグメント分子の組合せ方で数百万の薬剤構造を形成できるため、収集と管理が容易です。TargetMolではターゲットタンパク質のホットスポットにおいて見られる主要な相互作用を分析し、PDBで公開されているフラグメント-タンパク質複合体におけるフラグメントファーマコフォアを導出しました。この情報をもとに実験とファーマコフォアを組み合わせ、ほとんどの領域をカバーする多様性と最低限の化合物数への絞り込みを両立したフラグメントライブラリーを設計しました。FBDDの出発点探索にご活用ください。
ライブラリーの特徴:
Empty | 1000025-07-9 | 1000413-72-8 | 229005-80-5 | 1000787-75-6 | 946387-07-1 | 1000998-59-3 | 1175526-27-8 | 1001288-58-9 | 1001350-96-4 | 1001404-83-6 | Empty |
Vadadustat | TAK875 | TAK-779 | Tegobuvir | RN-1734 | BMS-687453 | AM211 | FT011 | BMS754807 | AAI101 | ||
Empty | 1001625-82-6 | 1001645-58-4 | 1001753-24-7 | 1001908-89-9 | 1002304-34-8 | 1002-84-2 | 100291-86-9 | 100299-08-9 | 10030-52-1 | 10040-45-6 | Empty |
RPW-24 | SRT1720 hydrochloride | INH6 | SRT 2183 | AMG208 | Pentadecanoic acid | Apiopaeonoside | Pemirolast potassium | L-Anserine nitrate salt | Sodium Picosulfate | ||
Empty | 100427-26-7 | 1004316-88-4 | 10045-45-1 | 100462-37-1 | 1004990-28-6 | 100-51-6 | 1005-24-9 | 1005264-47-0 | 1005334-57-5 | 1005342-46-0 | Empty |
Lercanidipine | Cobicistat | 1-Ethyl-2-benzimidazolinone | ROSIRIDIN | PF-AKT400 | Benzyl alcohol | 1-Methylnicotinamide chloride | MX69 | CVT-10216 | LCL161 | ||
Empty | 1005491-05-3 | 100-55-0 | 1005504-62-0 | 1005883-72-6 | 100643-71-8 | 1007207-67-1 | 10075-50-0 | 1007647-73-5 | 100784-20-1 | 10083-24-6 | Empty |
Tirasemtiv | Roniacol | Rg3039 | Z433927330 | Desloratadine | CH5132799 | 5-Bromoindole | Smurf1-IN-A01 | Halosulfuron-methyl | Piceatannol | ||
Empty | 100872-83-1 | 100874-08-6 | 1009119-64-5 | 1009119-65-6 | 100929-71-3 | 1009298-09-2 | 1009298-59-2 | 100929-99-5 | 1009734-33-1 | 10097-84-4 | Empty |
ML346 | SB 4 | Daclatasvir | Daclatasvir dihydrochloride | NADPH (tetracyclohexanamine) | AZD8055 | Vistusertib | PAβN dihydrochloride | HZ1157 | Rotundine | ||
Empty | 1009816-48-1 | 1009817-63-3 | 1009820-21-6 | 100986-85-4 | 101001-34-7 | 1010411-21-8 | 1010-60-2 | 1011244-68-0 | 1011301-27-1 | 1011529-10-4 | Empty |
Thiamet G | B-AP15 | Silmitasertib | Levofloxacin | Pamicogrel | GSK369796 Dihydrochloride | 2-Chloronaphthoquinone | TFAP | Tenovin3 | Azvudine | ||
Empty | 101152-94-7 | 101155-02-6 | 1011557-82-6 | 1011-74-1 | 101-20-2 | 1012054-59-9 | 101-21-3 | 101-26-8 | 101303-98-4 | 1013101-36-4 | Empty |
Milnacipran hydrochloride | BW-A78U | Tenovin-6 | DL-Normetanephrine hydrochloride | Triclocarban | CUDC101 | Chlorpropham | Mestinon | Zacopride hydrochloride | PF04691502 | ||
Empty | 101-31-5 | 1013-69-0 | 1013750-77-0 | 1013753-99-5 | 10138-52-0 | 1013920-15-4 | 1013937-63-7 | 1014691-61-2 | 101477-54-7 | 101494-95-5 | Empty |
L-Hyoscyamine | Noreugenin | ML-030 | BC-1382 | Gadolinium chloride | Vorolanib | VTP-27999 TFA | GSK0660 | Lomerizine hydrochloride | 8-CHLOROQUINAZOLIN-4(1H)-ONE |